Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r200Q8R281 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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