Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC49Q8IUZ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms