Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rab11fip3Q8CHD8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rab11fip3Q8CHD8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms