Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2Q1Q7Z7E8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2Q1Q7Z7E8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms