Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Brd2Q7JJ13 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brd2Q7JJ13 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms