Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms