Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMIM5Q71RC9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMIM5Q71RC9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms