Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chsy1Q6ZQ11 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chsy1Q6ZQ11 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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