Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprdQ64487 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PtprdQ64487 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PtprdQ64487 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PtprdQ64487 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PtprdQ64487 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PtprdQ64487 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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PtprdQ64487 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PtprdQ64487 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprdQ64487 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
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PtprdQ64487 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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PtprdQ64487 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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PtprdQ64487 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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PtprdQ64487 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprdQ64487 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms