Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf4Q64287 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf4Q64287 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms