Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vat1Q62465 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms