Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Itga6Q61739 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga6Q61739 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms