Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BcanQ61361 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BcanQ61361 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BcanQ61361 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BcanQ61361 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcanQ61361 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcanQ61361 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcanQ61361 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BcanQ61361 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BcanQ61361 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcanQ61361 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BcanQ61361 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BcanQ61361 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms