Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A1cfQ5YD48 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms