Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KHDC3LQ587J8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms