Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms