Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clpsl2Q3UW21 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clpsl2Q3UW21 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clpsl2Q3UW21 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms