Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IMPG1Q17R60 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPG1Q17R60 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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