Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf3ip1Q149C2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms