Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Vps8Q0P5W1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Vps8Q0P5W1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Vps8Q0P5W1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms