Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc7a1Q09143 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc7a1Q09143 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc7a1Q09143 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc7a1Q09143 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc7a1Q09143 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc7a1Q09143 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc7a1Q09143 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc7a1Q09143 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc7a1Q09143 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc7a1Q09143 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc7a1Q09143 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms