Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2Q07279 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfe2Q07279 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms