Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTNAP1P78357 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP1P78357 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CNTNAP1P78357 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP1P78357 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP1P78357 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP1P78357 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP1P78357 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP1P78357 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP1P78357 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP1P78357 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP1P78357 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP1P78357 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP1P78357 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP1P78357 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP1P78357 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP1P78357 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms