Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms