Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms