Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl11P48298 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl11P48298 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl11P48298 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl11P48298 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl11P48298 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl11P48298 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms