Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrprbP47758 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrprbP47758 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrprbP47758 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrprbP47758 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrprbP47758 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SrprbP47758 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms