Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp3P28862 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms