Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-DMAP28067 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HLA-DMAP28067 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms