Protein–RNA interactions for Protein: P28063

Psmb8, Proteasome subunit beta type-8, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb8P28063 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb8P28063 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms