Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA1P25391 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA1P25391 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms