Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB1P05556 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms