Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01915 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01915 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01915 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01915 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01915 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01915 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01915 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01915 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01915 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01915 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01915 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01915 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01915 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01915 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01915 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01915 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01915 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01915 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01915 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01915 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01915 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01915 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01915 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01915 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01915 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01915 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01915 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01915 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01915 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01915 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01915 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01915 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01915 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01915 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01915 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01915 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01915 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01915 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01915 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01915 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01915 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01915 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01915 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01915 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01915 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01915 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01915 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01915 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01915 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01915 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01915 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01915 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01915 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01915 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01915 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01915 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01915 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01915 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01915 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01915 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01915 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01915 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01915 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01915 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01915 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01915 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01915 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01915 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01915 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01915 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01915 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01915 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01915 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01915 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01915 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01915 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01915 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01915 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01915 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01915 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms