Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp26a1O55127 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp26a1O55127 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms