Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EDIL3O43854 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms