Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r80L7N1Z3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r80L7N1Z3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms