Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms