Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2035J3QP87 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2035J3QP87 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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