Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim34bJ3QNR8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim34bJ3QNR8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim34bJ3QNR8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim34bJ3QNR8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim34bJ3QNR8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim34bJ3QNR8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim34bJ3QNR8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim34bJ3QNR8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim34bJ3QNR8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim34bJ3QNR8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim34bJ3QNR8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms