Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
2610008E11RikG3X964 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
2610008E11RikG3X964 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2610008E11RikG3X964 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms