Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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Gcnt4E9Q649 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcnt4E9Q649 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcnt4E9Q649 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcnt4E9Q649 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcnt4E9Q649 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Gcnt4E9Q649 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Gcnt4E9Q649 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcnt4E9Q649 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcnt4E9Q649 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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Gcnt4E9Q649 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcnt4E9Q649 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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Gcnt4E9Q649 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Gcnt4E9Q649 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcnt4E9Q649 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms