Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia1B2RXQ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia1B2RXQ2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms