Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc9bA3KGF9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms