Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms