Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms