Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGAM5Q96HS1 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms