Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms