Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CCDC142Q17RM4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CCDC142Q17RM4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CCDC142Q17RM4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CCDC142Q17RM4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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