Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CHAF1BQ13112 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHAF1BQ13112 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHAF1BQ13112 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHAF1BQ13112 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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CHAF1BQ13112 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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CHAF1BQ13112 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CHAF1BQ13112 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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CHAF1BQ13112 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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CHAF1BQ13112 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHAF1BQ13112 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHAF1BQ13112 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHAF1BQ13112 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHAF1BQ13112 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHAF1BQ13112 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHAF1BQ13112 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHAF1BQ13112 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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