Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPAP23025 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPAP23025 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
XPAP23025 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPAP23025 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPAP23025 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPAP23025 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
XPAP23025 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPAP23025 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPAP23025 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPAP23025 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPAP23025 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPAP23025 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPAP23025 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPAP23025 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPAP23025 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XPAP23025 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XPAP23025 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPAP23025 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XPAP23025 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms